Пилотное исследование микробиоты глотки пациентов с фарингомикозом Medline.ru - медико-биологический информационный портал Медлайн.ру

Пилотное исследование микробиоты глотки пациентов с фарингомикозом

Межейникова М.О, Шляга И.Д., Ковалев А.А., Зятьков А.А., Шафорост А.С

Учреждение образования «Гомельский государственный медицинский университет» (УО «ГомГМУ»), Республика Беларусь, Гомель, 246000

Резюме
Фарингомикоз (ФМ) — грибковое поражение глотки, часто ассоциированное с болезнями органов дыхания (БОД). Современные исследования подчеркивают роль нарушения баланса микробиоты глотки в патогенезе ФМ и связь с нейропсихологическими нарушениями через ось "глотка-кишечник-мозг". Актуальность работы обусловлена ростом частоты ФМ (до 30% инфекций глотки) и недостаточной изученностью микробного профиля при этой патологии. Цель. Пилотное исследование микробиоты глотки пациентов с ФМ в рамках алгоритма организационных мероприятий раннего выявления и диагностики микоза глотки, ассоциированного с болезнями органов дыхания. Материалы и методы: В исследовании участвовали трое пациентов (двое детей 4 лет и женщина 38 лет) с БОД и симптомами ФМ. У всех методом 16S рРНК-секвенирования (платформа Illumina MiSeq) и ITS-анализа изучали состав бактериальной и грибковой микробиоты фарингеального секрета. Биоинформатическая обработка данных включала контроль качества (FASTQC), обрезку адаптеров (Trimmomatic) и таксономическую классификацию (Kraken2). Пациенты обследованы по авторскому алгоритму раннего выявления и диагностики микоза глотки. Выполнен статистический анализ данных. Критерием включения пациентов в исследование являлся длительно текущий микоз глотки на фоне болезней органов дыхания, подтвержденный клинически, микроскопически и микробиологически; критерием исключения - прием антибиотиков/антимикотиков за месяц до исследования. Результаты. У всех пациентов выявлен средне-высокий уровень тревожности (8-11 баллов по опроснику тревожности (ОТМГ)) и высокий риск (более 6 баллов) развития микоза глотки (МГ) по результатам экспресс-опросника (ЭОФМ). Выявлена высокая индивидуальная вариабельность микробиоты: доминировали анаэробы Prevotella (22.5-31.1%), Veillonella (9.7-17.0%) и Fusobacterium (4.0-8.5%). У всех пациентов отмечался дефицит защитных бактерий (Lactobacillus < 0.1%, Streptococcus снижен). Микобиота включала клинически значимые грибы: у детей преобладали Candida и Malassezia, у взрослой — Aspergillus (15.8%) и Malassezia. Индексы альфа-разнообразия подтвердили дисбиоз (Шеннона: 3.56-3.95), при этом у взрослого пациента разнообразие было выше. У детей обнаружен Candidatus Nanosynbacter (эпипаразит), а снижение бутират-продуцентов (Fusobacterium) ассоциировано с риском респираторных осложнений. Выводы. Исследование подтвердило отсутствие универсального микробного профиля при ФМ на фоне БОД, выявив ключевые закономерности: доминирование анаэробов, дефицит симбионтов, связь дисбиоза с тревожностью. Персонализированный подход, интегрирующий NGS-диагностику (16S/ITS), коррекцию микробиоты (пробиотики S. salivarius K12), антимикотическую диету и нейрореабилитацию (дыхательная гимнастика, метод Томатис), показал эффективность в достижении ремиссии. Алгоритм раннего выявления ФМ перспективен для внедрения в клиническую практику, но требует валидации на крупных когортах. Важными направлениями дальнейших исследований являются разработка пробиотиков на основе бутират-продуцентов и изучение роли Candidatus Nanosynbacter в структуре, изучаемой патологии.

Ключевые слова
микоз глотки, фарингомикоз, болезни органов дыхания, микробиота, микобиота, метагеномный анализ, биологическое разнообразие, высокопроизводительное секвенирование, тревожность.

(статья в формате PDF. Для просмотра необходим Adobe Acrobat Reader)

открыть статью в

новом окне

Список литературы

1. Стома И.О. Микробиом дыхательных путей: учебно-метод. пособие. Москва: ГЭОТАР-Медиа; 2023.

2. Межейникова М.О. Видовая структура микоза глотки пациентов с различной соматической патологией. Успехи медицинской микологии. 2024; 26: 181-185.

3. Стома И.О. Микробиом в медицине: рук. для врачей. М.: ГЭОТАР-Медиа; 2020.

4. Межейникова М.О., Челебиева Н.П., Новик А.В. Нейропсихологический статус пациентов с микозами глотки. Оториноларингология. Восточная Европа. 2023; 13(S2): 80-84.

5. Межейникова М.О., Челебиева Н.П., Новик А.В. Метаболическая ось «кишечник - глотка» при микозе глотки. Оториноларингология. Восточная Европа. 2023; 13(S2): 85-89.

6. Климко Н.Н., Козлова Я.И., Хостелиди С.Н. и др. Распространенность тяжелых и хронических микотических заболеваний в Российской Федерации по модели LIFE. Проблемы медицинской микологии. 2014; 16(1): 3-7. URL: https://mycology.szgmu.ru/files/MAPO_1_2014.pdf

7. Колесников Д.Б., Рапопорт С.И., Вознесенская Л.А. Современные взгляды на психосоматические заболевания. Клиническая медицина. 2014; (7). URL: https://cyberleninka.ru/article/n/sovremennye-vzglyady-na-psihosomaticheskie-zabolevaniya

8. Aliaga S., Clark R., Laughon M., et al. Changes in the Incidence of Candidiasis in Neonatal Intensive Care Units. Pediatrics. 2014; 133(2): 236-242. https://doi.org/10.1542/peds.2013-0671

9. Bartlett J.G. Management of respiratory tract infections. 3rd ed. Philadelphia; 2001: 178-182.

10. Findeisen D.G. Stress and immune response. On appropriate stress management for prevention and treatment of diseases. Z Arztl Fortbild (Jena). 1991; 85(11-12): 581-584.

11. Mausch K. Stress and diseases. Przegl Lek. 2004; 61(2): 86-89.

12. Шляга И.Д., Колядич Ж.В., Межейникова М.О., и др. Метод получения биологического материала из рото- и гортаноглотки: инструкция по применению. Гомель: ГомГМУ; 2023. 20 с.

13. FastQC: A Quality Control Tool for High Throughput Sequence Data. 2010. Available at: https:// https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/

14. Bolger A.M., Lohse M., Usadel B. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics. 2014; 30(15): 2114-2120. https://doi.org/: 10.1093/bioinformatics/btu170

15. Wood D.E., Lu J., Langmead B. Improved metagenomic analysis with Kraken 2. Genome Biol. 2019; 20:257. https://doi.org/10.1186/s13059-019-1891-0

16. Wood D.E., Salzberg S.L. Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments. Genome Biol. 2014; 15(3): R46. https://doi.org/10.1186/gb-2014-15-3-r46

17. RStudio Team. RStudio: Integrated Development for R. RStudio, PBC, Boston, MA; 2020. Available at:http://www.rstudio.com/

18. R Core Team. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria; 2022. Available at: https://www.r-project.org/

19. Wickham H., Averick M., Bryan J., et al. Welcome to the tidyverse. J Open Source Softw. 2019; 4(43): 1686. https://doi.org/10.21105/joss.01686

20. Kassambara A. rstatix: Pipe-Friendly Framework for Basic Statistical Tests. R package version 0.7.0; 2021. Available at: https://CRAN.R-project.org/package=rstatix

21. Лопатин А.С., Азизов И.С., Козлов Р.С. Микробиом полости носа и околоносовых пазух в норме и при патологии. Часть I. Российская ринология. 2021; 29(1): 23-30.

22. Wald E.R., Dashefsky B., Byers C., et al. Frequency and severity of infections in day care. J Pediatr. 1988; 112(4): 540-546. https://doi.org/10.1016/s0022-3476(88)80164-1

23. Угышова Ш.Е., Даниярова А.Б., Бегадилова Т.С., и др. Микробиом носоглотки у здоровых детей до 5-ти лет в условиях мегаполиса. Вестник Казахского Национального медицинского университета. 2020; (1): 184-186.

24. Kullberg R.F.J., Wikki I., Haak B.W., et al. Association between butyrate-producing gut bacteria and the risk of infectious disease hospitalisation: results from two observational, population-based microbiome studies. Lancet Microbe. 2024 (9):100864. https://doi.org/10.1016/S2666-5247(24)00079-X;5(9)

25. Boesmans L, Valles-Colomer M, Wan J, et al. Butyrate Producers as Potential Next-Generation Probiotics: Safety Assessment of the Administration of Butyricicoccus pullicaecorum to Healthy Volunteers. mSystems. 2018; 3(6): e00094-18. https://doi.org/10.1128/mSystems.00094-18

26. Baker J.L. Complete genome sequence of "Candidatus Nanosynbacter" strain HMT-348_TM7c-JB, a member of Saccharibacteria Clade G1. Microbiol Resour Announc. 2022; 11(5): e0002322. https://doi.org/10.1128/mra.00023-22

27. Торшин И.Ю., Громова О.А., Захарова И.Н., Максимов В.А. Хемомикробиомный анализ лактитола. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2019; (4): 111-121. https://doi.org/10.31146/1682-8658-ecg-164-4-111-121

28. Peng M., Tabashsum Z., Anderson M., et al. Effectiveness of probiotics, prebiotics, and prebiotic‐like components in common functional foods. Compr Rev Food Sci Food Saf. 2020; 19(4): 1908-1933.

29. Mandal S., Manda N.C. Current trends and future perspectives of probiotics on human health: an overview. In: De Mandal S, et al., editors. Recent advances and future perspectives of microbial metabolites. San Diego; 2023: 81-122.

30. Merenstein D.J., Tancredi D.J., Karl J.P., et al. Is there evidence to support probiotic use for healthy people? Adv Nutr. 2024 15(8): 100265. https://doi.org/10.1016/j.advnut.2024.100265

31. Ивашкин В.Т., Горелов А.В., Абдулганиева Д.И. и др. Методические рекомендации Научного сообщества по содействию клиническому изучению микробиома человека (НСОИМ) и Российской гастроэнтерологической ассоциации (РГА) по применению пробиотиков, пребиотиков, синбиотиков, метабиотиков и обогащенных ими функциональных пищевых продуктов для лечения и профилактики заболеваний гастроэнтерологического профиля у взрослых и детей. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2024; 34(4): 113-136.

32. Шевяков М.А., Мелехина Ю.Э., Королева Ю.Г. Роль пробиотиков и постбиотиков в лечении орофарингеального кандидоза (обзор литературы). Проблемы медицинской микологии. 2024; 26(3): 11-16.

33. Малкина-Пых И.Г. Психосоматика: справ. практ. психолога. М.: Эксмо; 2005.

34. Бодрова Р.А., Аухадеев Э.И., Ахунова Р.Р., Хусаинова Э.Р. Подходы к выбору технических средств реабилитации с помощью МКФ. Физическая и реабилитационная медицина, медицинская реабилитация. 2019; 1(4): 64-71.

35. Корсун В.Ф., Лавренова Г.В., Корсун Е.В., Султанбеков Б.А. Лекарственные растения в ЛОР-практике: рук. по клин. фитотерапии. СПб.: Эко-Вектор; 2019.