Медико-биологический
информационный портал
для специалистов
 
БИОМЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ Medline.ru

СОДЕРЖАНИЕ ЖУРНАЛА:
Физико-химическая биология

Клиническая медицина

Профилактическая медицина

Медико-биологические науки


АРХИВ:

Фундаментальные исследования

Организация здравохраниения

История медицины и биологии



Последние публикации

Поиск публикаций

Articles

Архив :  2000 г.  2001 г.  2002 г. 
               2003 г.  2004 г.  2005 г. 
               2006 г.  2007 г.  2008 г. 
               2009 г.  2010 г.  2011 г. 
               2012 г.  2013 г.  2014 г. 
               2015 г.  2016 г.  2017 г. 
               2018 г.  2019 г.  2020 г. 

Редакционная информация:
        Опубликовать статью
        Наша статистика


 РЕДАКЦИЯ:
Главный редактор

Заместители главного редактора

Члены редколлегии
Специализированные редколлегии


 УЧРЕДИТЕЛИ:
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
"Институт токсикологии Федерального медико-биологического агентства"
(ФГБУН ИТ ФМБА России)

Институт теоретической и экспериментальной биофизики Российской академии наук.

ООО "ИЦ КОМКОН".




Адрес редакции и реквизиты

199406, Санкт-Петербург, ул.Гаванская, д. 49, корп.2

ISSN 1999-6314

Российская поисковая система
Искать: 


«
Vol. 12, Art. 77 (pp. 924-935)    |    2011       
»

Detection of herpesviruses using oligonucleotide microarray
Klotchenko S.A.1,2, Tepereva K.S.1, Burylev V.V.2, Plotnikova M.A.1, Smirnova T.D.1, Egorov V.V.1, Chebotkevich V.N.2, Vasin A.V.1

1- Research Institute of Influenza of the Ministry of Health and Social Development of the Russian Federation, St. Petersburg, Russia
2- Russian Research Institute of Hematology and Transfusiology, St. Petersburg, Russia



Brief summary

Herpesviruses cause severe, often life-threatening infections in immunocompromised patients. They require rapid diagnosis and prompt treatment. Since the clinical diagnostics of herpesvirus infections is complicated and often impossible, various laboratory methods, mainly polymerase chain reaction, are used. In this paper we proposed a new method for human herpesvirus diagnostics using oligonucleotide microarray technology. The developed biochip allows simultaneous detection of eight human viruses: Herpes simplex virus 1 and 2 types (HSV-1 and 2), Varicella zoster virus (VZV), Epstein–Barr virus (EBV), Cytomegalovirus (CMV) and Herpesviruses 6, 7 and 8 types (HHV 6, 7 and 8). The laboratory sample biochip specifically identifies the control samples of DNA of herpesviruses accumulated in cultured human cells as well as the clinical samples of DNA of patients with herpesvirus infections.


Key words

herpesviruses, oligonucleotide microarray, PCR, molecular diagnostics





(The article in PDF format. For preview need Adobe Acrobat Reader)



Open article in new window

Reference list

1. Lvov D. K. i dr. Medicinskaya virysologiya. Rykovodstvo // M.: OOO «Medicinskoe informacionnoe agentstvo». – 2008. - 656 s.


2. Bykrinskaya A. G. Virysologiya // M.: «Medicina». – 1986. - 336 s.


3. Isakov V. A. Gerpecvirysnie infekcii cheloveka: Rykovodstvo dlya vrachei // SPb: «SpecLit». – 2006. - 303 s.


4. Mirzabekov A. D. Biochipi v biologii i medicine XXI veka // Vestnik RAN. – 2003. – t. 73, № 5. – S. 412—422.


5. Wernersson R., Nielse H. B. OligoWiz 2.0 – integrating sequence feature annotation into design of microarray probes // Nucleic Acids Res. – 2005. – v.33. – P.611–615.


6. Rozen S., Skaletsky H. J. Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers // Methods Mol. Biol. – 2000.- v. 132. – P.365–386.


7. McGinnis S., Madden T. L. BLAST: at the core of a powerful and diverse set of sequence analysis tools // Nucleic Acids Res. – 2004. v.32. – P.20–25.


8. Maniatis T., Frich E., Sembryk D. Molekylyarnoe klonirovanie // M.: «Mir». – 1984. - 480 s.


9. Davison A. J., Eberle R., Hayward G. S. Family Herpesviridae. In Virus Taxonomy, VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses // London: Academic Press. – 2005. – P.193–212.


10. Kiselev O. I. i dr. Voprosi obshei virysologii: Ychebnoe posobie // SPb: SPbGMA im. I. I. Mechnikova. – 2007. - 374 s.


11. Benson D. A. , Karsch-Mizrachi I., Lipman D. J., Ostell J., Sayers E. W. GenBank // Nucleic Acids Res. – 2011. – v.39. – P.32–37.


12. Vasin A. V., Sandybaev N. T., Plotnikova M. A., Klotchenko S. A., Chervyakova O. V., Strochkov V. M., Taylakova E. T., Elpaeva E. A., Komissarov A. B., Egorov V. V., Koshemetov J. K., Kiselev O. I., Mamadaliev S. M. Multisegment one-step RT-PCR fluorescent labeling of influenza A virus genome for use in diagnostic microarray applications // Journal of Physics: Conference Series. – 2011. – v.291 (012006). – P.1–5.



Свидетельство о регистрации сетевого электронного научного издания N 077 от 29.11.2006
Журнал основан 16 ноября 2000г.
Выдано Министерством РФ по делам печати, телерадиовещания и средств массовых коммуникаций
(c) Перепечатка материалов сайта Medline.Ru возможна только с письменного разрешения редакции

Размещение рекламы

Rambler's Top100