БИОМЕДИЦИНСКИЙ ЖУРНАЛ МЕДЛАЙН.РУ
Содержание журнала

Архив

Редакция
Учредители

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-клинический центр токсикологии имени академика С.Н. Голикова Федерального медико-биологического агентства»


Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт теоретической и экспериментальной биофизики
Российской академии наук


ООО "ИЦ КОМКОН"

Адрес редакции и реквизиты

199406, Санкт-Петербург, ул.Гаванская, д. 49, корп.2

ISSN 1999-6314


Фундаментальные исследования • Фармакология

Том: 12
Статья: « 81 »
Страницы:. 980-989
Опубликована в журнале: 25 сентября 2011 г.

English version

Прогнозирование связывания лекарственынх веществ с альбумином на основе физико-химических свойств лигандов

Пшенкина Н.Н.

ФГВОУ ВПО "Военно-медицинская академия им. С.М.Кирова" МО РФ
194044, Санкт-Петербург, ул. Академика Лебедева, 6


Резюме
В экспериментах in vitro были получены значения констант взаимодействия с альбумином для 50 лекарственных веществ, обладающих различным фармакологическим действием. Физико-химические свойства для этих соединений были рассчитаны с помощью методов компьютерной химии и послужили предикторами при разработке уравнений регрессии с целью прогнозирования константы связывания лигандов с альбумином. Разработанные уравнения регрессии позволили с достаточной долей вероятности спрогнозировать значения константы взаимодействия, и прошли валидацию с использованием независимой выборки лекарственных соединений.


Ключевые слова
альбумин, лекарственные вещества, связывание, физико-химические свойства, прогнозирование.



(статья в формате PDF. Для просмотра необходим Adobe Acrobat Reader)



открыть статью в новом окне

Список литературы

1. Kamal J.K.A., Zhao L., Zewail A.H. Ultrafast hydration dynamics in protein unfolding: Human serum albumin // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. - 2004. - Vol.101. - №37. - P.13411-13416.


2. Peters T., Jr. All about albumin: biochemistry, genetics and medical application. San Diego: Academic Press. - 1996.


3. Seedher N ., Bhatia S. Mechanism of interaction of the non-steroidal antiinflammatory drugs meloxicam and nimesulide with serum albumin // J. Pharm. Biomed. Anal. - 2005. - Vol.39. - №1-2. - P.257-262.


4. Aarons L . Kinetics of drug-drug interactions // Pharmacol. Ther. - 1981. - Vol.14. - №3. - P.321-344.


5. Perucca E ., Richens A. Interpretation of drug levels: relevance of plasma protein binding // Ciba Found. Symp. - 1979. - Vol.74. - P.51-68.


6. Seydel J.K ., Schaper K.J. Quantitative structure-pharmacokinetic relationships and drug design // Pharmacol. Ther. - 1981. - Vol.15. - №2. - P.131-182.


7. Carter D.C ., Ho J.X. Structure of serum albumin // Adv. Protein. Chem. - 1994. - Vol.45. - P.153-203.


8. Ferrer M.L ., Duchowicz R., Carrasco B., de la Torre J.G., Acuna A.U. The conformation of serum albumin in solution: a combined phosphorescence depolarization - hydrodynamic modeling study // Biophys. J. - 2001. - Vol.80. - №5. - P.2422-2430.


9. Kragh-Hansen U. Molecular aspects of ligand binding to serum albumin // Pharmacol. Rev. - 1981. - Vol.33. - №1. - P.17-53.


10. Sugio S., Kashima A., Mochizuki S., Noda M., Kobayashi K. Cristal structure of human serum albumin at 2.5 Ǻ resolution // Prot. Engineering. - 1999. - Vol.12. - №6. - P.439- 446.


11. Kratochwil N.A., Huber W., Müller F., Kansy M., Gerber P.R. Predicting plasma protein binding of drugs: A new approach // Biochem. Pharmacol. – 2002. - Vol. 64, № 9. – P. 1355-1374.


12. Hall L.M., Hall L.H., Kier L.B. Modeling drug albumin binding affinity with e-state topological structure representation // J. Chem. Inf. Comput. Sci. – 2003. – Vol.43. – P.2120-2128.


13. Molinspiration. Calculation of Molecular Properties and Bioactivity Score. URL: http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties


14. Quantum Pharmaceuticals. URL: http://q-pharm.com


15. DrugBank database. URL: http://www.drugbank.ca


16. Лакович Дж. Основы флуоресцентной спектроскопии. М.: Мир. 1986. 485с.


17. Регистр лекарственных средств России. Справочник по лекарственным препаратам и их производителям. URL: http://www.rlsnet.ru